O Κώστας Κακογιάννης είναι διπλωματούχος στο πιάνο, βιολί, φλάουτο και διδασκαλία. Σπούδασε Electrical Engineering, ενώ με υποτροφία Fulbright μετέβη στις Η.Π.Α. για σπουδές στη σύνθεση και ανώτερα θεωρητικά. Αποφοιτά πρώτος με  το βραβείο του καλύτερου συνθέτη και με υποτροφία βρίσκεται στο Eastman School of Music για μεταπτυχιακές σπουδές στη σύνθεση μουσικής για τον κινηματογράφο. Εκεί διδάσκει στο Πανεπιστήμιο Ηλεκτρονική Μουσική.

Κέρδισε τους διαγωνισμούς σύνθεσης των BMI και GWUC και τιμήθηκε με τα βραβεία Pi kappa Lambda και James Ming. Από το 1994 μέχρι το 1998 είναι μαέστρος του πολιτιστικού ομίλου Διάσταση στην Κύπρο. Έχει συνεργαστεί ως συνθέτης με πολλούς καλλιτέχνες, μεταξύ των οποίων ο Μιχάλης Κακογιάννης, ο Γιώργος Νταλάρας, η Αλέξια , η Νάνα Μούσχουρη,  η Καλλιόπη Βέττα,  ο George Moustaki, ο Δημήτρης Παπαϊωάννου, o Μιχάλης Χατζηγιάννης και ο Johnny Logan.

Έχει συνθέσει μουσική για μπαλέτο, καθώς και για πολλές τηλεοπτικές σειρές, το θέατρο και τον κινηματογράφο. Η μουσική του έχει εκτελεσθεί σε διάφορες αίθουσες και θέατρα ανά τον κόσμο, όπως το Δημαρχείο του Σικάγου, το Haus der Culturen του Βερολίνου, το Παλάτι του Κρεμλίνου, τα Bloomsbery και Her Majesty's του Λονδίνου, το Ηρώδειο και το Μέγαρο Μουσικής Αθηνών.

 Το 2006 έγραψε τη μουσική για τις παραγωγές του Φεστιβάλ Αθηνών «Εκκλησιάζουσαι» και «Κοριολανός» που σκηνοθέτησε ο Μιχάλης Κακογιάννης  στο Ηρώδειο. Μέχρι σήμερα έχει κυκλοφορήσει 17 CD.

Με τον Πάμπο Κουζάλη έχουν  ιδρύσει το πολιτιστικό κέντρο «Παράκεντρο» που εδρεύει στη Λεμύθου και σκηνοθετήσει το βραβευμένο ντοκιμαντέρ «Στέλιος» καθώς και μια σειρά από ντοκιμαντέρ, βιντεοποιήματα και μουσικά βίντεο. Πρόσφατα του έχει ανατεθεί από την EBU η μουσική διεύθυνση της Junior Eurovision 2008.